Promotie N.J. (Niels) Keijzer

Hieronder volgt een korte samenvatting van het proefschrift:

Eiwitten zijn minuscule moleculaire machines die in iedere cel praktisch alle processen uitvoeren die ons lichaam nodig heeft. Eiwitten kunnen zelfs meerdere functies uitvoeren, en ze moeten flexibel kunnen wisselen afhankelijk van wat de cel nodig heeft. Dit vereist dat eiwitten zorgvuldig gereguleerd worden, anders kunnen er ziektes ontstaan. De cel kan hiervoor ubiquitine aan een eiwit te plakken: Zo krijgt dat eiwit een andere functie, of kan het afgebroken worden. In dit proefschrift onderzoeken we ‘deubiquitinatie’, het proces waarmee ubiquitine juist van eiwitten afgehaald kan worden, waarin de focus ligt op  het mechanisme van deubiquitinerende enzymen van de USP eiwit-familie. De resultaten geven nieuwe inzichten in de werking en regulatie van verschillende USPs, welke laten zien dat individuele USPs ondanks hun overeenkomsten, zich moleculair op belangrijke manieren van elkaar onderscheiden. Zo laten we zien dat USP1/UAF1 een ubiquitine-keten knippend mechanisme dat anders is dan dat van alle andere USPs. USP48 blijkt een C-terminale peptide te hebben dat lijkt op het peptide van andere USPs, maar welke zich op belangrijke manieren onderscheid. Tot slotte laten we zien dat het mechanisme van katalyse zelf, waarvan werd gedacht dat het gedeeld is door alle USPs, eigenlijk varieert tussen individuele USPs en daarmee complexer is dan gedacht werd. De biochemische en structurele studies van dit proefschrift stellen ons in staat om een gedetailleerd inzicht te verkrijgen in de nuances van eiwitten, wat ons kan leiden en helpen bij een beter begrip van de cel.