Promotie M.E. (Maria) Oomen

Chromosomen zijn de structurele eenheden die onze genomen bevatten. Het proces van chromosoomvouwing wordt derhalve nauwlettend gemoduleerd om de regulatie van transcriptie, bescherming tegen DNA-schade en het behoud van epigenetische kenmerken mogelijk te maken. Ogenschijnlijk tegenstrijdig hieraan ondergaan chromosomen  dramatische conformatieveranderingen tijdens de celcyclus. Nadat het DNA gerepliceerd is moeten de twee kopieën (de zusterchromatiden) ontward worden en uiteindelijk condenseren om een goede splitsing naar de twee nieuwe dochtercellen tijdens de mitose mogelijk te maken. Opvallend is dat typische interfasestructuren zoals TADs en compartimenten verdwijnen tijdens mitose, en dat chromosomen worden gereorganiseerd in een spiraalvormige reeks van lussen die wordt gemedieerd door lusvormende machines. Mitotische markeringen zoals histonmodificaties, histonvarianten en zelfs bepaalde chromatinebindende factoren blijven echter behouden, wat mogelijk een rol speelt in het snelle herstel van de organisatie van interfasechromosomen na mitose. Het doel van dit proefschrift was om de kenmerken van mitotische chromosomen te onderzoeken. Op een gedetailleerd niveau hebben wij de bindingsdynamiek van CTCF, een belangrijk architecturaal eiwit in interfasechromosomen, bestudeerd. Daarnaast onderzochten we de mitotische markeringen rond CTCF-bindingsplaatsen in zowel gedifferentieerde cellen als stamcellen. Op hoger genomisch niveau hebben we interacties waargenomen tussen en binnen zusterchromatiden in gistcellen. Hiervoor ontwikkelden we een nieuwe Hi-C-techniek: SisterC.

De promoties vinden, in verband met het coronavirus, niet op de gebruikelijke wijze publiekelijk plaats in de Senaatszaal of in de Professor Andries Queridozaal. De kandidaten zullen hun proefschrift in een klein gezelschap of online verdedigen.