Promotie S.E. (Shirley) Braspenning

Proefschrift in het kort:

Mijn onderzoek draait om het varicella-zoster virus (VZV), een herpesvirus dat zowel waterpokken veroorzaakt bij kinderen, als gordelroos bij volwassenen. Tussen deze twee ziekte-episodes verblijft het virus in een winterslaap-achtige staat in de zenuwen; latentie. Tijdens latentie is het virus stil en worden er geen nieuwe virusdeeltjes gemaakt. Waar waterpokken meestal een milde ziekte is, komen er bij gordelroos vaak complicaties voor die slecht te behandelen zijn. Het is daarom belangrijk om te begrijpen hoe het virus zich vermenigvuldigt en hoe het latentie bewerkstelligt en onderhoudt. Deze kennis zal uiteindelijk bijdragen aan de ontwikkeling van nieuwe medicijnen die het latente virus kunnen verwijderen of kunnen gordelroos kunnen voorkomen.

In deze thesis beschrijf ik de ontdekking van een nieuw viraal gen (VLT), dat specifiek tijdens de latente fase tot expressie komt en mogelijk bijdraagt aan het stilhouden van het virus. We hebben CRISPR/Cas9 gebruikt om dit eiwit uit het virus te verwijderen, en laten zien dat zonder VLT het virus nog steeds groeit, maar langzamer. Daarna hebben we de eiwit-interacties van VLT bestudeerd om zo een mogelijke functie voor het eiwit te ontdekken. 

In het tweede deel van mijn thesis hebben we state-of-the-art sequencing technieken gebruikt om de complexiteit van genexpressie in Varicelloviruses gedurende lytische infectie te ontrafelen. Hiermee hebben we gedefinieerd in welke volgorde het virus zijn genen tot expressie brengt, wat cruciaal om uiteindelijk de levenscyclus van het virus te begrijpen. Daarnaast hebben we geanalyseerd tot op welk niveau genexpressie vergelijkbaar is tussen twee nauw verwante herpesvirussen.