Promotie D.E. (Dimard) Foudraine

Proefschrift in het kort:

In de studies beschreven in dit proefschrift werden meerdere testen ontwikkeld en gevalideerd voor de vroege detectie van antimicrobiële resistentiemechanismen in E. coli en K. pneumoniae, twee soorten bacteriën die een aanzienlijke ziektelast veroorzaken. De ontwikkelde testen maken gebruik van een combinatie van vloeistofchromatografie en hoge-resolutie massaspectrometrie (LC-MS/MS). Het hoofddoel van deze studies was om de potentie van LC-MS/MS voor de vroege detectie van resistentiemechanismen te demonstreren. Dit is van belang omdat er nieuwe snelle en accurate testen nodig zijn voor de detectie van resistente bacteriën, om zo in een vroeg stadium de juiste antibiotica te kunnen geven aan patiënten die lijden aan bacteriële infecties. Binnen het project lag de nadruk op resistentie tegen bèta-lactam antibiotica, aminoglycosiden en fluorochinolonen omdat deze antibiotica vaak gebruikt worden voor infecties veroorzaak door E. coli en K. pneumoniae. In het project werd resistentie tegen deze antibiotica bestudeerd middels een combinatie van eiwit- en genoomanalyse. Daarnaast werden gerichte LC-MS/MS testen ontwikkeld voor de detectie van de meest voorkomende mechanismen die lijden tot resistentie tegen carbapenems en aminoglycosiden. Verder werden E. coli stammen bestudeerd die in het laboratorium langdurig aan meropenem waren blootgesteld. Uiteindelijk werd een enkele LC-MS/MS test ontwikkeld voor de snelle detectie van 27 bacteriële resistentiemechanismen in bloedkweken. In de toekomst streven wij ernaar om de test uit te breiden zodat ook bacteriële resistentiemechanismen tegen andere antibiotica gedetecteerd kunnen worden en om de ontwikkelde test verder te automatiseren en daardoor geschikter te maken voor de routine diagnostiek.